Форум Татарского исторического архива

Дерево N

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« : 05 Декабря 2015, 07:40:29 »
В сборнике про еланцев есть филогенетическое дерево гаплогруппы N, предполагаю составленное Волковым :



1 Филогенетические деревья построены на основании данных, полученных в различных коммерческих и научных лабораториях (Family Tree DNA (США), Full Genomes Corporation (США)), лаборатории эволюционной генетики НИИ медицинской генетики (Томск, Россия) и эстонского биоцентра (Тарту, Эстония (http://evolbio.ut.ee)). Значительная часть данных о статусе SNP-маркеров обработана командой YFull (http://www.yfull.com).

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #1 : 27 Февраля 2016, 22:27:34 »


samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #3 : 08 Июля 2016, 18:27:38 »

Дерево N
« Ответ #4 : 09 Июля 2016, 20:00:32 »


Как раз вот с этой статьей и пытаюсь разобрать.

Что сразу бросается в глаза - так это высокий процент у народов Поволжья N-B211 (их номенклатуре) или же более известно как N-Y9022. Собственно сам снип Y9022 у них не выявлен, но многие снипы этого уровня там фигурируют. У татар в данной статье эта линия не выявлена, но по коммерческим тестам известно, что линия эта у нас не редкая. Собственно у нас по коммерческим тестам известен группирующийся кластер с четкими маркерам, например, DYS389II=28. По приведенным ими маркерам - нашлось 2 чувашских гаплотипа с этим значением. Также мы предполагаем, что подтвержденный N-Y9022 крымский татар (ногаи) близок этому кластеру.

Далее бросается в глаза некий татар N-B187 (N3b), линия характерная для хакасов (встречается также у шорцев, алтайцев и тувинцев). Вот его хотелось бы заполучить для коммерческого тестирования.

Скриннинг снипов также показал, что основной линией N1c1 у татар является N-Z1936. Но это достаточно разнообразная ветвь, в которую входят карельские и просто финны на западе и вплоть до групп угорского происхождения. Известно, что сделано 3 полногеномных исследования Y-хромосомы татар, которые из ветви N-Y13850 названная в этой статье В539 и образовавшие три ветви под В539 (Y13850) и параллельные В540 (L1034) - В539>B545 [xB546, xB547], В539>B545>В546, В539>B545>B547.

Также вызывает интерес ветвление N1c2 (N2a в статье). Татары там представлены почти во всех линиях.

Вот самые поверхностные наблюдение после публикации данных.

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #5 : 09 Июля 2016, 20:15:24 »
Интересно, что за снипы N1c2: В525 и В528 ?

Дерево N
« Ответ #6 : 09 Июля 2016, 20:26:29 »
Интересно, что за снипы N1c2: В525 и В528 ?

Этого не знаю,  B525, как я понял, объединились в результате полногеномного анализа Y-хромосомы араба, афганца и турка и имет 14 эквивалентных снипа, а В528 - после такого же анализа у ханта и удмурта, там 9 эквивалентных снипа.

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #7 : 09 Июля 2016, 20:37:43 »
Y9022- это ананьевская ветка. А B211 точно тоже самое? Случаем не может быть N3b-B187?

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #8 : 09 Июля 2016, 20:39:37 »
Т.е. с номенклатурой авторы порядком перемудрили, разобраться будет не легко.

Дерево N
« Ответ #9 : 09 Июля 2016, 20:46:53 »
Y9022- это ананьевская ветка. А B211 точно тоже самое? Случаем не может быть N3b-B187?

Да, Y9022 и B211 - одна и та же ветвь. Самого снипа позиции Y9022 они не знают, но среди эквивалентов В211 нашел позиции: Y9280, Y9023, Y9283, Y9284, Y9285, Y9286, Y9287, Y9026, Y9081, Y9027, Y9028, Y9288, Y9289, Y9029, Y9279, Y10758, Y10893. Некоторые эквивалентные позиции из их статьи - не нашел среди снипов серии "Y".

B187 - это из тех, что L708-, а Y9022 под L708.

Дерево N
« Ответ #10 : 09 Июля 2016, 20:50:22 »
Т.е. с номенклатурой авторы порядком перемудрили, разобраться будет не легко.

Авторы не поименовали эквивалентные снипы отдельно, т.е. куча снипов с названием В211 и так по другим веткам, а также не проверяли известны ли те снипы, которые они нашли сами.

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #11 : 09 Июля 2016, 21:09:26 »
Понятно.

samtat

  • *****
  • 885
Дерево N
« Ответ #12 : 22 Августа 2016, 19:43:57 »
Продублирую здесь: