Форум Татарского исторического архива

ДНК Проект => Аутосомы => Тема начата: Булат от 25 Мая 2016, 22:27:36

Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Булат от 25 Мая 2016, 22:27:36
Я хотел бы обсудить здесь какую кому удалось информацию выудить из совпадений по аутосомным ДНК (Family Finder test на Family Tree DNA)?

Я придумал для себя следующую любительскую методологию интерпретации результатов.
1. Я сначала смотрю самых генетически близких родственников с татарскими именами (документально я не нашел ни одного предка не из мещеряков).
2. По каждому из близких совпадений я смотрю общие совпадения. Family finder может автоматически показывать такой список. Так я могу разбить все свои сопадения на группы, соответствующие генетически "близким" родственникам моих генетически близких родственников.
3. Внутри каждой группы я смотрю данные по географии их известных предков. По моему наблюдению, все люди внитри группы, живут в одном географическом регионе.
4. Так же обычно внутри группы можно выделить основные национальности (мещеряки, чуваши и тп). Национальности внутри групп обычно более однородные чем в общей выборке совпадений.

У меня есть следующие гипотезы по поводу результатов. Каждая такая группа родственников должна соответствовать отдельной линии моих предков. Соответствующая линия идет из одного из населенных пунтков участников группы. Преобладающая национальность в группе может соответсвовать национальности моей соответсвующей линии.

5. При наличии тестов родителей и их родителей, можно разделить полученные группы по соовтетвующим четырем линиям (например, мужская линия со стороны матери). Если повезло, то каждая группа попадет только на одну из четырех линий. Возможно, что группы могут иметь генетическое пересечение с несколькими линиями. Тогда интерпертация усложняется.

По идее, при большой выборке совпадений такая система классификации должна помочь найти основные населенные пункты на пути миграции моих предков, возможно помочь найти нужную ревизскую сказку и подтвердить догадку документально.

Пока у меня  совпадения ложатся хорошо между Нижним Новгродом и Башкирией, что соответствует историческому переселению мишар в 16-18 веках. Красная Горка -> Тетюши->Север Башкирии-> Центральная Башкирия. Разумеется, в этом нет ничего удивительного. Есть ли где либо карта миграции мишар? Вместе с документальной картой заселения по разным годам можно было бы что--то сказать более конктретное по каждой группе. Эталоном у меня в голове стоит карта миграций Y-гаплогрупп из Африки. Можно подобные оценки делать и на масштабе 200-500 лет для каждого человека по аутосомным ДНК, если заморочиться.
Что вы считаете по поводу осмысленности этого упражнения?
Удалось ли кому--нибудь из формучан выудить что--нибудь интересное из своих совпадений?
Как вы интерпретируете появление финнов и балтийских народов в выборку совпадений?

И последний вопрос.  FF тест может показывать , что у меня есть общий предок с моим совпадением 3-5 поколений назад (2-4 th cousin). Судя по географическому разбросу моих совпадений реальный общий предок мог быть и 10-15 поколений назад. Мишаре жили в малых деревнях, в браки вступали 2-3 юродные братья и сестры. В итоге у дальних родственников из мещеряков может быть больше общих генов, чем в модельной популяции без браков между родственниками. Насколько завышенна оценка родства у теста Family Finder по вашему опыту?
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Таракан от 25 Мая 2016, 22:36:09
Как таковое конкретно я родственников не ищу. Имея широкий разброс по предкам (все разные и удаленные друг от друга населенные пункты) - задачу по ПМЛ решить не смогу, тем более, что вглубь до 17 века сегментов почти не остается от того предка.

Меня больше интересуют этнопортреты - поэтому я отправляю свои результаты по аутосомам Сергею Козлову и он мне высылает обработку по компонентам и этнокалкуляторам.
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Булат от 25 Мая 2016, 22:38:48
Как таковое конкретно я родственников не ищу. Имея широкий разброс по предкам (все разные и удаленные друг от друга населенные пункты) - задачу по ПМЛ решить не смогу, тем более, что вглубь до 17 века сегментов почти не остается от того предка.

Меня больше интересуют этнопортреты - поэтому я отправляю свои результаты по аутосомам Сергею Козлову и он мне высылает обработку по компонентам и этнокалкуляторам.

Если сегментов от настоящего предка не остается, то выходит, что практически все совпадения  -- случайные. Так?
Где можно узнать про этнокалькуляторы?
Что такое ПМЛ?
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Таракан от 25 Мая 2016, 22:52:43
Если сегментов от настоящего предка не остается, то выходит, что практически все совпадения  -- случайные. Так?
Где можно узнать про этнокалькуляторы?
Что такое ПМЛ?

Пмл - прямая мужская линия.

Все сегменты, естественно, от общих предков. Совпадения не случайны. Все зависит от длины сегмента. Общие сегменты у нас есть и с неандертальцами, но они совсем крохотные.

Я скину маил Козлова, если хотите ему скинуть свои аутосомы для того, чтобы он посмотрел по предковым компонентам и этнокалькуляторам своим. Он скажет какие файлы надо будет скачать с аккаунта ФТДНА.
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Булат от 25 Мая 2016, 23:08:05
Если сегментов от настоящего предка не остается, то выходит, что практически все совпадения  -- случайные. Так?
Где можно узнать про этнокалькуляторы?
Что такое ПМЛ?

Пмл - прямая мужская линия.

Все сегменты, естественно, от общих предков. Совпадения не случайны. Все зависит от длины сегмента. Общие сегменты у нас есть и с неандертальцами, но они совсем крохотные.

Я скину маил Козлова, если хотите ему скинуть свои аутосомы для того, чтобы он посмотрел по предковым компонентам и этнокалькуляторам своим. Он скажет какие файлы надо будет скачать с аккаунта ФТДНА.
Спасибо ! Я с Сергеем не знаком. Он какой--то профессионал генетик? Я все что знаю про ДНК генеалогию прочел на сайте  ftDNA. Я дилетант--энтузиаст.
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Таракан от 25 Мая 2016, 23:13:37
Если сегментов от настоящего предка не остается, то выходит, что практически все совпадения  -- случайные. Так?
Где можно узнать про этнокалькуляторы?
Что такое ПМЛ?

Пмл - прямая мужская линия.

Все сегменты, естественно, от общих предков. Совпадения не случайны. Все зависит от длины сегмента. Общие сегменты у нас есть и с неандертальцами, но они совсем крохотные.

Я скину маил Козлова, если хотите ему скинуть свои аутосомы для того, чтобы он посмотрел по предковым компонентам и этнокалькуляторам своим. Он скажет какие файлы надо будет скачать с аккаунта ФТДНА.
Спасибо ! Я с Сергеем не знаком. Он какой--то профессионал генетик? Я все что знаю про ДНК генеалогию прочел на сайте  ftDNA. Я дилетант--энтузиаст.

Он не генетик, но у него обширная база данных по аутосомам (главное, что народов России, а не англичан), которые ему присылали как протестировавшиеся в ФТДНА, так и по научным выборкам. Многие татары сделавшие аутосомы тоже ему отослали свои результаты.
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Булат от 25 Мая 2016, 23:20:07
Нашел ответ на свой вопрос про эндогамные популяции на сайте http://isogg.org/wiki/Endogamy
Ашкеназы, будучи замкнутой группой, могут интерпретировать совпадения как родственников только при наличии очень длинных блоков в 23 сентиморгена.
Название: Что можно узнать о предках из совпадений по аутосомным ДНК?
Отправлено: Булат от 01 Августа 2016, 18:07:38
Если сегментов от настоящего предка не остается, то выходит, что практически все совпадения  -- случайные. Так?
Где можно узнать про этнокалькуляторы?
Что такое ПМЛ?

Пмл - прямая мужская линия.

Все сегменты, естественно, от общих предков. Совпадения не случайны. Все зависит от длины сегмента. Общие сегменты у нас есть и с неандертальцами, но они совсем крохотные.

Я скину маил Козлова, если хотите ему скинуть свои аутосомы для того, чтобы он посмотрел по предковым компонентам и этнокалькуляторам своим. Он скажет какие файлы надо будет скачать с аккаунта ФТДНА.
Спасибо ! Я с Сергеем не знаком. Он какой--то профессионал генетик? Я все что знаю про ДНК генеалогию прочел на сайте  ftDNA. Я дилетант--энтузиаст.

Он не генетик, но у него обширная база данных по аутосомам (главное, что народов России, а не англичан), которые ему присылали как протестировавшиеся в ФТДНА, так и по научным выборкам. Многие татары сделавшие аутосомы тоже ему отослали свои результаты.


Сергей Козлов очень даже генетик и профессионал:

Козлов С.В. — выпускник МФТИ, в настоящее время ведущий ученый Центра современных предклинических исследований Национального института рака США (г.Фредерик, шт.Мериленд), признанный специалист по созданию мышиных нокаутных моделей для изучения молекулярных механизмов, лежащих в основе разнообразных биологических процессов, таких как канцерогенез, воспаление и преждевременное старение.

https://ccr.cancer.gov/capr/teams/technology-and-optimization/serguei-kozlov